Нью-Йоркский университет в Праге предлагает ряд профессиональных программ последипломного образования для тех студентов, которые хотят развивать свою карьеру, и подготовить себя на руководящие должности. Курсы МВА проходят в течение выходных, что делает их идеальными профессионалов, которые хотят повысить квалификацию и карьеру, но которые не хотят прервать график работы. Существует гибкий он-лайн курс. Студенты изучают курс из дома, но есть возможность принять участие в университетских семинарах.

Курсы MBA охватывают такие основные курсы:
• Организационное поведение и лидерство.
• Управление маркетингом.
• Финансовый учет.
• Управленческий учет.
• Управление операциями.
• Правовые и этические решения.
• Информационные системы для руководителей.
• Переговоры и разрешение конфликтов.
• Финансовое управление

После завершения основных предметов, студенты могут выбрать специализацию. Программы МВА доступны по таким специализациям: